Về hệ động vật rừng
Theo thống kê chưa đầy đủ ở Khu bảo tồn thiên nhiên Hòn Bà có 321 loài 90 họ thuộc 27 bộ trong đó có 56 loài động vật quý hiếm.
- Về thú: Kết quả các cuộc điều tra đã ghi nhận (chưa đầy đủ) KBTTN Hòn Bà có 70 loài thú trong 23 họ ở 9 bộ. So với tài nguyên thú của cả nước là 252 loài, 41 họ, 14 bộ (Lê Vũ Khôi, 2002) thì tài nguyên thú của khu vực có số loài chiếm 27%, số họ chiếm 56% và số bộ chiếm 64%. Loài thú đáng chú ý là Vượn đen má hung (Nomascus gabriellae) và Chà vá chân đen (Pygathrix nigripes). Ngoài 2 loài trên, linh trưởng khác ở Hòn Bà được ghi nhận là còn rất nhiều như Khỉ vàng (Macaca mulatta) và Khỉ mặt đỏ (Macaca arctoides), Khỉ đuôi lợn (Macaca nemestrina)… với tiềm năng rất lớn cần có sự nghiên cứu điều tra thêm về linh trưởng.
- Về chim: Khu hệ chim có 144 loài, 49 họ thuộc 14 bộ với các loài như Trĩ sao (Rheinartia ocellata), Gà rừng (Gallus gallus), Cu gáy (Streptopelia chinensis), Hồng hoàng (Buceros bicornis), Vẹt ngực đỏ (Psittacula alexandri), Sơn ca (Alauda gulgula), Khướu đầu đen (Garrulax milleti), Cú lợn lưng xám (Tyto alba), Cú vọ (Glaucidium cuculoides), Khách đuôi cờ (Temnurus temnurus),…
- Về lưỡng cư – bò sát: Gồm 107 loài ở 18 họ thuộc 4 bộ với các loài quý hiếm và đặc hữu như Cóc đốm Hòn Bà (Kalophrynus honbaensis), Cóc này mắt trăng (Leptobrachium leucops), Nhái bầu cây (Microhyla arboricola), Thằn lằn ngón Yang Bay (Cyrtodactylus yangbayensis), Tắc kè đá (Gekko grossmanni) Ếch cây ma cà rồng (Rhacophorus vampyrus), Cóc rừng (Ingerophrynus galeatus), Rắn cạp nong (Bungarus fasciatus), Rùa núi hộp lưng đen (Cuora amboinensis), Tắc kè (Gekko gecko), Kỳ đà hoa (Varanus salvator),…